在組織學實驗室中，水無處不在。它用于水浴，浮浴以及實驗室中存在的大多數(shù)自動化儀器（染色機，組織處理器等）中。質(zhì)量差的水可能會生成硬質(zhì)沉積物或細菌生物膜，從而可能干擾這些儀器的正常運行。此外; 由于水是組織學實驗室制備的許多試劑的主要成分，因此水污染物可能會干擾zui終載玻片的質(zhì)量。

組織學中使用了許多不同的染色劑，每種都有獨特的特性。不幸的是，文獻中沒有具體描述可能干擾每種類型污漬的特定污染物。因此，大多數(shù)組織技術(shù)人員在解決染色問題時都依賴偶然性和經(jīng)驗。另外，組織學程序涉及自來水，去離子水或蒸餾水的使用，這使人們對選擇哪種類型的水感到困惑。

水的質(zhì)量可能會影響試劑質(zhì)量和染色過程。劣質(zhì)的水可能導致污漬沉淀（如銀色污漬），或降低其化學穩(wěn)定性。染色反應基于各種基本化學反應，例如酸堿化學或氧化還原。因此，可能會干擾這些反應的化學污染物可能會改變?nèi)旧|(zhì)量。zui終染色可能更淺，或者相反，可能會有更高的背景或非特異性結(jié)合。也可能獲得錯誤的顏色或特異性。

使用純凈水可以可靠地降低水污染物干擾染色過程的風險，并確保染色機和組織處理器正常工作。

以下水污染物可能會影響組織學：

• 自來水中經(jīng)常存在的氯會對各種類型的污漬產(chǎn)生漂白作用。
   
• 眾所周知，諸如鈣和各種金屬之類的離子會干擾各種污漬（銀污漬等）。例如，如果水中的氯化物含量過高，則會形成AgCl沉淀物。
   
• 有機物：如果水中含有大量有機分子和其他營養(yǎng)物，細菌和霉菌可能會在水浴和組織漂浮浴，染色機和組織處理器管內(nèi)部以及溶液中生長，并可能在載玻片上產(chǎn)生偽影。
   
• 細菌：用于水浴和制備溶液的水應避免細菌污染。細菌及其副產(chǎn)物可能會粘附在組織切片上，并在載玻片上產(chǎn)生偽影。
   
• 顆粒：用于水浴和制備溶液的水應不含顆粒。顆粒材料可能粘附在組織部分上，并在載玻片上產(chǎn)生偽影。它們還可能在儀表管線內(nèi)形成沉積物并改變其功能。
   
• 硬度和二氧化硅：水硬度和二氧化硅可能會在染色機和組織處理器的內(nèi)部形成沉積物并改變其功能。這些水污染物也可能沉積在組織和載玻片上。
   
• pH值：盡管嚴格意義上講pH值不是水污染物，但由于存在不同的水污染物，它可能會發(fā)生變化。某些污漬對pH高度敏感，例如阿爾辛藍或三色。通過盡可能減少水中離子和有機酸的含量，可以使水的pH值保持在7附近。